Welcome to ProteinDF User’s Manual

Contents:

• 1. はじめに
  • 1.1. 免責事項
  • 1.2. ライセンス
  • 1.3. 連絡先
  • 1.4. 謝辞
  • 1.5. 更新履歴
• 2. 概要
  • 2.1. 特徴
  • 2.2. 計算手法
  • 2.3. 計算サイズ
  • 2.4. その他
• 3. インストール
  • 3.1. 動作環境
  • 3.2. インストールと準備
• 4. クイックスタートガイド
  • 4.1. 計算用ディレクトリの用意
  • 4.2. 入力ファイルの準備
  • 4.3. ProteinDFの実行
  • 4.4. 結果の表示
• 5. 入力ファイル
  • 5.1. 構文
  • 5.2. MAINセクション
  • 5.3. MOLECULEセクション
• 6. 実行方法
  • 6.1. プログラムの実行方法
• 7. 動作形式
  • 7.1. 概要
  • 7.2. serial
  • 7.3. replica_static
  • 7.4. replica_dynamic
  • 7.5. distributed
• 8. 基底状態計算
  • 8.1. 計算方法
  • 8.2. 電子数・電子占有状態の指定
  • 8.3. 初期値の指定
  • 8.4. クーロン項の計算
  • 8.5. Fock交換項の計算
  • 8.6. 交換相関項の計算
  • 8.7. レベルシフト計算
  • 8.8. 収束加速法
• 9. ProteinDF計算結果の解析
  • 9.1. 一般的に用いられる解析ツール
  • 9.2. 上級者(デバッグ)用ツール
• 10. 全自動計算プログラムQCLO
  • 10.1. はじめに
  • 10.2. 実行方法
  • 10.3. 自動計算法プログラムの入力キーワード
• 11. 付録
  • 11.1. ProteinDF起動オプション
  • 11.2. 入力パラメータリスト
  • 11.3. 入力ファイルフォーマット
  • 11.4. basis2ファイルフォーマット

Indices and tables

• 索引
• モジュール索引
• 検索ページ