proteindf_bridge.biopdb モジュール¶

class proteindf_bridge.biopdb.Pdb(file_path=None, mode=None)[ソース]¶

ベースクラス: object

AmberToolsVer = 22¶

property debug¶

get_atomgroup(select_model=None, select_altloc='A')[ソース]¶

AtomGroupオブジェクトを返す

戻り値の型:: AtomGroup

get_modpdb_atomgroup(ag_protein)[ソース]¶

残基または原子の名前を変更する。: 'set_by_atomgroup()' から呼ばれる

パラメータ:: ag_protein (AtomGroup) -- タンパク質のAtomGroupオブジェクト
戻り値:: 名前変更後のオブジェクト
戻り値の型:: AtomGroup

load(file_path)[ソース]¶

renumber()[ソース]¶

set_by_atomgroup(atomgroup, is_charge2tempfactor=False)[ソース]¶

戻り値の型:: None

proteindf_bridge.biopdb.main()[ソース]¶