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ProteinDF_bridge 2026.8.0
ProteinDF_bridge 2026.8.0

目次

  • インストール
  • コマンドラインツール
  • proteindf_bridge
    • proteindf_bridge パッケージ
      • proteindf_bridge.amber_prmtop モジュール
      • proteindf_bridge.aminoacid モジュール
      • proteindf_bridge.atom モジュール
      • proteindf_bridge.atomgroup モジュール
      • proteindf_bridge.biopdb モジュール
      • proteindf_bridge.bond モジュール
      • proteindf_bridge.common モジュール
      • proteindf_bridge.dbmanager モジュール
      • proteindf_bridge.error モジュール
      • proteindf_bridge.format モジュール
      • proteindf_bridge.functions モジュール
      • proteindf_bridge.gro モジュール
      • proteindf_bridge.ionpair モジュール
      • proteindf_bridge.mail モジュール
      • proteindf_bridge.matrix モジュール
      • proteindf_bridge.mmcif モジュール
      • proteindf_bridge.modeling モジュール
      • proteindf_bridge.mol2 モジュール
      • proteindf_bridge.neutralize モジュール
      • proteindf_bridge.path モジュール
      • proteindf_bridge.periodictable モジュール
      • proteindf_bridge.position モジュール
      • proteindf_bridge.select モジュール
      • proteindf_bridge.ssbond モジュール
      • proteindf_bridge.str_processing モジュール
      • proteindf_bridge.superposer モジュール
      • proteindf_bridge.superposer_quaternion モジュール
      • proteindf_bridge.utils モジュール
      • proteindf_bridge.vector モジュール
      • proteindf_bridge.xyz モジュール
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proteindf_bridge.xyz モジュール¶

class proteindf_bridge.xyz.Xyz(*args, **kwargs)[ソース]¶

ベースクラス: object

get_atom_group()[ソース]¶

AtomGroupオブジェクトを返す

get_text()[ソース]¶
load(file_path)[ソース]¶
save(file_path)[ソース]¶
set_by_atomgroup(atomgroup)[ソース]¶
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proteindf_bridge.vector モジュール
Copyright © 2014, The ProteinDF development team
Made with Sphinx and @pradyunsg's Furo
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  • proteindf_bridge.xyz モジュール
    • Xyz
      • Xyz.get_atom_group()
      • Xyz.get_text()
      • Xyz.load()
      • Xyz.save()
      • Xyz.set_by_atomgroup()