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ProteinDF_bridge 2026.8.0
ProteinDF_bridge 2026.8.0

目次

  • インストール
  • コマンドラインツール
  • proteindf_bridge
    • proteindf_bridge パッケージ
      • proteindf_bridge.amber_prmtop モジュール
      • proteindf_bridge.aminoacid モジュール
      • proteindf_bridge.atom モジュール
      • proteindf_bridge.atomgroup モジュール
      • proteindf_bridge.biopdb モジュール
      • proteindf_bridge.bond モジュール
      • proteindf_bridge.common モジュール
      • proteindf_bridge.dbmanager モジュール
      • proteindf_bridge.error モジュール
      • proteindf_bridge.format モジュール
      • proteindf_bridge.functions モジュール
      • proteindf_bridge.gro モジュール
      • proteindf_bridge.ionpair モジュール
      • proteindf_bridge.mail モジュール
      • proteindf_bridge.matrix モジュール
      • proteindf_bridge.mmcif モジュール
      • proteindf_bridge.modeling モジュール
      • proteindf_bridge.mol2 モジュール
      • proteindf_bridge.neutralize モジュール
      • proteindf_bridge.path モジュール
      • proteindf_bridge.periodictable モジュール
      • proteindf_bridge.position モジュール
      • proteindf_bridge.select モジュール
      • proteindf_bridge.ssbond モジュール
      • proteindf_bridge.str_processing モジュール
      • proteindf_bridge.superposer モジュール
      • proteindf_bridge.superposer_quaternion モジュール
      • proteindf_bridge.utils モジュール
      • proteindf_bridge.vector モジュール
      • proteindf_bridge.xyz モジュール
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proteindf_bridge.mmcif モジュール¶

class proteindf_bridge.mmcif.SimpleMmcif(file_path=None)[ソース]¶

ベースクラス: object

get_atomgroup(name)[ソース]¶
get_molecule_names()[ソース]¶
load(file_path)[ソース]¶
load_msgpack(file_path)[ソース]¶
save_msgpack(file_path)[ソース]¶
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  • proteindf_bridge.mmcif モジュール
    • SimpleMmcif
      • SimpleMmcif.get_atomgroup()
      • SimpleMmcif.get_molecule_names()
      • SimpleMmcif.load()
      • SimpleMmcif.load_msgpack()
      • SimpleMmcif.save_msgpack()